Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TM4SF18Q96CE8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TM4SF18Q96CE8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms