Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS9Q8WXC6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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COPS9Q8WXC6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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COPS9Q8WXC6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS9Q8WXC6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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