Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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C15orf40Q8WUR7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
C15orf40Q8WUR7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C15orf40Q8WUR7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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