Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF439Q8NDP4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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