Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FSIP1Q8NA03 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms