Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q1

CYB561D1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561D1Q8N8Q1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CYB561D1Q8N8Q1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561D1Q8N8Q1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms