Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00612Q8N6U2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00612Q8N6U2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms