Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCL2Q8N4E4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms