Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT9Q86SS6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT9Q86SS6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYT9Q86SS6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT9Q86SS6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms