Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
HRCT1Q6UXD1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HRCT1Q6UXD1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms