Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF2Q6PJF5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF2Q6PJF5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF2Q6PJF5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF2Q6PJF5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF2Q6PJF5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF2Q6PJF5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF2Q6PJF5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF2Q6PJF5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHBDF2Q6PJF5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RHBDF2Q6PJF5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RHBDF2Q6PJF5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RHBDF2Q6PJF5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RHBDF2Q6PJF5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RHBDF2Q6PJF5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHBDF2Q6PJF5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms