Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHDC7AQ5VTJ3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms