Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCK2Q16822 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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