Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSX1Q16384 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms