Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC6Q16204 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
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