Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
VAMP3Q15836 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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