Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCARB2Q14108 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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