Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CUL4BQ13620 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CUL4BQ13620 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4BQ13620 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4BQ13620 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4BQ13620 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4BQ13620 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CUL4BQ13620 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4BQ13620 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4BQ13620 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4BQ13620 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4BQ13620 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4BQ13620 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4BQ13620 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4BQ13620 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4BQ13620 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4BQ13620 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CUL4BQ13620 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CUL4BQ13620 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4BQ13620 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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