Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAF3Q13114 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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