Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BPTFQ12830 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BPTFQ12830 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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