Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM27E3Q08E93 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms