Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms