Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPCQ03188 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPCQ03188 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms