Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 ZEB2P1-202ENST00000572816 902 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 CHAC2-201ENST00000295304 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 LINC01198-206ENST00000595532 1125 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms