Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ID3Q02535 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ID3Q02535 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ID3Q02535 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID3Q02535 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID3Q02535 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID3Q02535 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID3Q02535 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID3Q02535 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID3Q02535 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ID3Q02535 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms