Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms