Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNB1P62873 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GNB1P62873 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GNB1P62873 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GNB1P62873 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GNB1P62873 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GNB1P62873 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GNB1P62873 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GNB1P62873 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNB1P62873 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GNB1P62873 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GNB1P62873 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms