Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC34P49427 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC34P49427 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC34P49427 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC34P49427 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC34P49427 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC34P49427 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC34P49427 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC34P49427 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDC34P49427 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDC34P49427 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDC34P49427 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDC34P49427 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDC34P49427 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDC34P49427 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDC34P49427 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDC34P49427 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDC34P49427 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC34P49427 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC34P49427 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC34P49427 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CDC34P49427 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDC34P49427 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC34P49427 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CDC34P49427 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC34P49427 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC34P49427 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDC34P49427 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDC34P49427 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDC34P49427 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC34P49427 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDC34P49427 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC34P49427 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDC34P49427 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDC34P49427 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDC34P49427 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDC34P49427 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDC34P49427 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDC34P49427 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDC34P49427 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDC34P49427 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDC34P49427 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDC34P49427 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDC34P49427 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDC34P49427 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDC34P49427 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms