Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP214P35658 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP214P35658 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP214P35658 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP214P35658 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP214P35658 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP214P35658 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP214P35658 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP214P35658 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP214P35658 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP214P35658 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP214P35658 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP214P35658 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP214P35658 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP214P35658 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP214P35658 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP214P35658 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP214P35658 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP214P35658 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP214P35658 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP214P35658 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP214P35658 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP214P35658 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP214P35658 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP214P35658 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP214P35658 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP214P35658 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP214P35658 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP214P35658 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP214P35658 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP214P35658 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP214P35658 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms