Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2E2P29084 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms