Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GCSHP23434 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
GCSHP23434 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
GCSHP23434 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
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