Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRF1P14222 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRF1P14222 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRF1P14222 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRF1P14222 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRF1P14222 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRF1P14222 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRF1P14222 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRF1P14222 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRF1P14222 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRF1P14222 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRF1P14222 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms