Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC192P0DO97 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC192P0DO97 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms