Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms