Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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LRRTM2O43300 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRRTM2O43300 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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