Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBDO15205 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBDO15205 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBDO15205 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBDO15205 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBDO15205 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBDO15205 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBDO15205 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms