Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TSPAN4O14817 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TSPAN4O14817 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TSPAN4O14817 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TSPAN4O14817 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TSPAN4O14817 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TSPAN4O14817 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPAN4O14817 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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