Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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