Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG6Q9Y2V7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG6Q9Y2V7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms