Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
INO80Q9ULG1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms