Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NRXN1Q9ULB1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NRXN1Q9ULB1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms