Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNL1Q9UK58 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNL1Q9UK58 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms