Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL4Q9UJQ4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms