Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHL42Q9P2K6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms