Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 NUMBL-204ENST00000595741 559 ntTSL 426.4■■□□□ 1.825e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.795e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 ZFP36L1-203ENST00000553375 633 ntTSL 225.5■■□□□ 1.675e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.679e-7■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 FAM49B-216ENST00000520204 699 ntTSL 525.46■■□□□ 1.675e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 RHOT2-212ENST00000564659 854 ntTSL 225.43■■□□□ 1.665e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 TNFAIP2-202ENST00000558056 421 ntTSL 525.23■■□□□ 1.635e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NRDC-205ENST00000468722 754 ntTSL 325.22■■□□□ 1.635e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.585e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 FAM49B-211ENST00000519070 561 ntTSL 324.89■■□□□ 1.575e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.565e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.555e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NUMBL-210ENST00000600636 555 ntTSL 424.69■■□□□ 1.545e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.535e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFS8-202ENST00000432321 936 ntTSL 224.58■■□□□ 1.535e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 RNF5-204ENST00000487940 357 ntTSL 224.57■■□□□ 1.525e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.495e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.475e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PSMD13-202ENST00000382671 1489 ntTSL 1 (best)24.26■■□□□ 1.475e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFS8-214ENST00000531796 615 ntTSL 324.08■■□□□ 1.455e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.425e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFS8-203ENST00000453471 620 ntTSL 323.87■■□□□ 1.415e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 ZFP36L1-205ENST00000557022 577 ntTSL 523.71■■□□□ 1.395e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 FAM229A-201ENST00000415596 446 ntTSL 323.59■■□□□ 1.375e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PSMD13-204ENST00000525665 1632 ntTSL 523.22■■□□□ 1.315e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFS8-206ENST00000525628 515 ntTSL 223.21■■□□□ 1.315e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.275e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.275e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 STK11-206ENST00000586358 770 ntTSL 522.94■■□□□ 1.265e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFS8-212ENST00000531228 531 ntTSL 222.93■■□□□ 1.265e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 TPR-205ENST00000474852 2757 ntTSL 1 (best)22.75■■□□□ 1.235e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.225e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.195e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 SLC25A28-203ENST00000479722 581 ntTSL 222.42■■□□□ 1.185e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.125e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PTS-203ENST00000525645 1069 ntTSL 1 (best)21.59■■□□□ 1.055e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFS8-207ENST00000526339 689 ntTSL 221.48■■□□□ 1.035e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PTS-209ENST00000531673 986 ntTSL 1 (best)21.4■■□□□ 1.025e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 STK11-204ENST00000585851 505 ntTSL 321.33■■□□□ 15e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 STK11-209ENST00000593219 637 ntTSL 321.12■□□□□ 0.975e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.925e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 VPS28-211ENST00000530790 561 ntTSL 220.44■□□□□ 0.865e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFS8-211ENST00000529645 606 ntTSL 320.35■□□□□ 0.855e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 YWHAZ-214ENST00000517727 876 ntTSL 320.11■□□□□ 0.815e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PSMD13-209ENST00000529372 612 ntTSL 519.93■□□□□ 0.785e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PSMD13-208ENST00000528906 858 ntTSL 519.85■□□□□ 0.775e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 MIB2-209ENST00000477990 2821 ntTSL 219.79■□□□□ 0.765e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.755e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.725e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFS8-215ENST00000532399 3072 ntTSL 219.57■□□□□ 0.725e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 RHOT2-220ENST00000569197 530 ntTSL 519.44■□□□□ 0.75e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.665e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.615e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PSMD13-201ENST00000352303 1427 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.595e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 POFUT2-204ENST00000451615 795 ntTSL 518.68■□□□□ 0.585e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PTS-207ENST00000528679 846 ntTSL 218.62■□□□□ 0.575e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 SLC25A28-202ENST00000434701 1005 ntTSL 518.29■□□□□ 0.525e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 FAM49B-220ENST00000522250 1647 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.515e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PSMD13-206ENST00000527047 1284 ntTSL 1 (best)18.14■□□□□ 0.495e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.495e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.465e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.465e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 NDUFS8-210ENST00000528492 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.395e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PCSK9-201ENST00000302118 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.235e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 FAM49B-215ENST00000519824 3798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.235e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 ZFP36L1-202ENST00000439696 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.225e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 ASAP1-215ENST00000524299 550 ntTSL 416.14■□□□□ 0.175e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.175e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 HDAC5-204ENST00000586802 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.175e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 RHOT2-208ENST00000562957 397 ntTSL 215.98■□□□□ 0.155e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PSMD13-214ENST00000534590 787 ntTSL 515.58■□□□□ 0.085e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 TRIM27-203ENST00000414543 1813 ntTSL 315.44■□□□□ 0.065e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 PCSK9-202ENST00000490692 3891 ntTSL 214.42□□□□□ -0.15e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 ZNF441-202ENST00000409902 2828 ntTSL 214.15□□□□□ -0.145e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.215e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.245e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 SLC25A28-204ENST00000496035 744 ntTSL 313.15□□□□□ -0.35e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 TRIM27-205ENST00000481474 7006 ntTSL 1 (best)12.41□□□□□ -0.425e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 AP3B1-201ENST00000255194 5838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.535e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 ZNF441-201ENST00000357901 4356 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.65e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 ASAP1-212ENST00000521426 566 ntTSL 411.14□□□□□ -0.635e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 DNAJC6-204ENST00000463018 546 ntTSL 38.97□□□□□ -0.975e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 ASAP1-209ENST00000520927 742 ntTSL 58.93□□□□□ -0.985e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.165e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 ASAP1-211ENST00000521075 5406 ntTSL 1 (best)7.26□□□□□ -1.255e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 FAM49B-213ENST00000519142 696 ntTSL 56.33□□□□□ -1.45e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 MSI2-212ENST00000579590 452 ntTSL 56.28□□□□□ -1.45e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.635e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 MSI2-215ENST00000582453 496 ntTSL 34.4□□□□□ -1.75e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 FAM49B-203ENST00000517672 548 ntTSL 54.05□□□□□ -1.765e-6■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 MRPS6-202ENST00000477091 1061 ntTSL 526.92■■□□□ 1.94e-9■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.454e-9■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.414e-9■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 MRPS6-205ENST00000488492 909 ntTSL 59.77□□□□□ -0.844e-9■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.734e-9■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 UBQLN4-203ENST00000472638 654 ntTSL 530.36■■■□□ 2.455e-7■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.765e-7■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 TCF25-224ENST00000570116 1947 ntTSL 523.36■■□□□ 1.336e-7■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 EFHC1-204ENST00000491749 496 ntTSL 438.19■■■■□ 3.79e-8■■■□□ 14.8
DROSHAQ9NRR4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.219e-8■■■□□ 14.8
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