Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms