Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNCQ9H7C4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNCQ9H7C4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNCQ9H7C4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNCQ9H7C4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNCQ9H7C4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNCQ9H7C4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNCQ9H7C4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNCQ9H7C4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNCQ9H7C4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNCQ9H7C4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNCQ9H7C4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNCQ9H7C4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNCQ9H7C4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNCQ9H7C4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms