Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HDHD3Q9BSH5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms