Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PMCHL2Q9BQD1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMCHL2Q9BQD1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms