Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW6

SLC7A6OS, Probable RNA polymerase II nuclear localization protein SLC7A6OS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A6OSQ96CW6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC7A6OSQ96CW6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms